土壤动物跳虫肠道微生物的提取方法

2018-06-11 16:45:00     来源: 贤集网

土壤动物数量众多,种类丰富,在土壤生态系统中扮演着关键的作用。另一方面,肠道微生物对宿主的健康具有重要作用,土壤动物肠道微生物是土壤微生物组的重要组成部分,但是人们对土壤动物肠道微生物的认识却十分缺乏。随着人类活动的加剧,大量污染物进入了土壤生态系统,他们对土壤动物的影响已经引起了大家广泛的关注。但是污染物对土壤动物肠道微生物的影响却仍不清楚。提升土壤动物肠道内抗性基因多样性的认识,有助于了解抗性基因在土壤食物网中的传递与影响。


中国科学院城市环境研究所城市土壤与生物地球化学研究组,通过高通量测序与高通量定量PCR等技术,率先建立了土壤动物跳虫肠道微生物的提取方法,发现抗生素浓度可以显著降低土壤动物跳虫肠道微生物的丰度、组成与多样性,显著增加抗性基因的丰度与多样性(如图)。这些结果有助于提升对土壤动物肠道微生物及抗性基因在土壤食物网中传递的风险的认识。

肠道微生物与抗性基因的变化

该研究结果以Antibiotics Disturb the Microbiome and Increase the Incidence ofResistance Genes in the Gut of a Common Soil Collembolan为题发表于《环境科学与技术》(EST;DOI:10.1021/acs.est.7b04292)。该研究得到了国家自然科学基金、中科院先导科技专项B类和国际合作与交流项目等的支持。

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